AKP İktidarının yıllardır devletin yapısallığında yaptığı değişikler, Milli Savunma Teşkilatı kurulmasıyla TSK’nın yapısına yansımaya başlamıştı.
AKP, bu kezde TSK bünyesinde sivil personal çalıştırılmak şartıyla Din İşler Başkanlığı kurdu.
Konuya ilişkin kanunda şu ifadeler yer aldı:
‘Milli Savunma Bakanlığı Din Hizmetleri Başkanlığı teşkilatındaki personel Türk ordusunun hiyerarşik yapısı içinde muadili başkanlık, şube müdürlükleri ve birimlerindeki personel gibi rütbeli bir personeldir. Bu personel bünyesinde bulunduğu komutanlık emrinde görev yapar. Milli Savunma Bakanlığı’ndan din hizmetlerine ilişkin emir, tebliğ ve uygulamaları komutanlık ile koordine eder. Komutanlıklara dini müşavirlik yapar ve din hizmetlerinin yürütülmesinden sorumlu personeldir.’